Как обновить CodeIgniter до последней версии?

Сергей, обычно сам редко кто занимается обновлением CI в движке, т.к. это практически бессмысленная работа - при обновлении движка все результаты работы будут потеряны. Большинство коллег (и я в том числе), придерживаются стратегии - подождать когда Максим официально обновит CI до последней версии.

Что касается CI 3, то недавно где-то (не могу найти чтобы дать ссылку) читал ответ Максима, что он пока что переводить движок на третью ветку фреймфворка не планирует. Возможно чуть позже, когда фреймворк обретёт стабильность.

На самом деле, особой целесообразности переходить на новую версию CI именно сейчас - нет. Движок то и текущие возможности второй ветки использует не полностью. А чтобы как-то задействовать нововведения CodeIgniter 3 скорее всего нужно будет провести заметный рефакторинг функций движка. Думаю, что это будет сделано, но чуть позже. Сейчас перед разработчиками стоят более «прозаические» задачи - вылизывание интерфейса админки, освоение новой методологии разработки шаблонов, разработка шаблонов и плагинов. В общем, как-то так.