Можно ли выключить ЧПУ чтобы ссылки были типа id12345?

Отключить ЧПУ не получится - оно вшито в движок и является неотъемлемой частью логики его работы. Но если вы хотите адреса типа: http://сайт/id12345, то есть такой вариант, который можно попробовать реализовать:

1. Убедиться, что в настройках движка разрешено использование синонимов ссылок. для этого откройте файл \application\config\mso_config.php и проверьте чтобы была закомментирована строка:

# $config['mso_permalink_no_slug'] = "no"; // полностью отключить синонимы

2. Если «id12345» это просто обозначение статьи с ID 12345, то ничего делать не нужно, ибо движок сам должен открывать статью с ID 12345 если обратиться к ней по адресу http://сайт/12345
3. Если «id12345» это именно адрес в котором присутствуют буквы id, то вам нужно вручную прописывать для каждой страницы slug в виде «id12345».
4. В любом случае, вам потом потребуется убедиться, что все виджеты, страницы рубрик, тэгов, архива, карты сайта формируют ссылки без slug-а page. Возможно придётся что-то переделать в шаблонах вывода этих страниц.

Теперь можно воспользоваться плагином friendly_urls